動員含軍隊在內一萬多人圍勦，全村幾乎滅村

1952年，在一位因「臺北市委會電器工人支部案」被捕的案主日記中，記載北部有一共產黨武裝基地，保密局推測該基地位於鹿窟、瑞芳、玉桂嶺一帶。於是，1952年12月29日清晨，保密局動員將近一萬人摸黑深入山區，尋找鹿窟的「地下共產武裝基地」。
在那個漆黑的夜裡，一萬多民軍人、警察、特務將山區封鎖，每三十尺設立一個崗哨，將鹿窟山區包圍的密不透風。一早，軍警不分青紅皂白的拘捕上街的的礦工、村民，並送往鹿窟的菜廟（今光明寺）拘留，有896人遭到逮捕或訊問。訊問期長達三個星期，軍隊在搜捕期間任意掠奪村民的家禽農作等財產，並將被捕的村民囚禁於光明寺內，禁止換洗、休息與睡眠。在訊問過程中，保密局不惜動用酷刑刑求村民，再依逼供得來的不實證詞將其定罪。根據受難者的回憶，刑求方式有鋼筆夾手、拔指甲、灌水倒吊等，甚至還有村民被打到骨頭錯位而終生殘廢。